文章摘要
李艳红,杨亚莉,陈芬,等.数据挖掘技术在雌激素对心血管的分子调控网络中的应用[J].安徽医药,2020,24(8):1541-1544.
数据挖掘技术在雌激素对心血管的分子调控网络中的应用
Application of data mining technology in molecular regulation network of estrogen on cardiovascular
  
DOI:10.3969/j.issn.1009?6469.2020.08.015
中文关键词: 雌激素类/生理学  数据挖掘  基因调控网络  心血管  GEO数据库  蛋白互作网络
英文关键词: Estrogens/physiology  Data mining  Gene regulatory networks  Cardiovascular  GEO database  Protein?pro?tein interaction network
基金项目:湖北省自然科学基金(2016CFB344)
作者单位E-mail
李艳红 长江大学附属仙桃市第一人民医院 心电图室湖北仙桃 433000  
杨亚莉 长江大学附属仙桃市第一人民医院 心电图室湖北仙桃 433000  
陈芬 华中科技大学同济医学院附属协和医院心内科湖北武汉 430022 54113447@qq.com 
万翔 长江大学附属仙桃市第一人民医院心内科湖北仙桃 433000  
龚芳 襄阳市中心医院湖北文理学院附属医院心内科湖北襄阳 441021  
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中文摘要:
      目的探讨数据挖掘技术在雌激素对心血管的分子调控网络中的应用。方法利用 GEO2R在线分析工具进行差异基因分析,采用 DAVID 6.8进行基因功能和通路富集分析,采用 STRING数据库进行蛋白互作网络分析,采用 MCODE算法提取核心网络。结果共筛选出 192个差异基因,将差异基因进行 GO与信号通路富集分析后发现,这些基因与脂代谢、血管生成、 PPAR信号通路、脂肪酸降解信号通路等有关。蛋白互作网络分析得到一个包含 131基因的互作关系网络, MCODE算法分析提取出其中 5个核心子网络,分别与胆固醇平衡、胰岛素分泌、铁离子平衡、血管新生以及生长激素受体信号通路等生物学功能和信号通路有关。结论应用数据挖掘技术可以发现雌激素对心血管系统的影响与脂质代谢、胰岛素分泌、血管新生和细胞生长等途径有关。
英文摘要:
      Objective To explore the application of data mining technology in molecular regulation network of estrogen on cardio? vascular.Methods The online analysis tool GEO2R was used to analyze differential gene,DAVID 6.8 was used for gene function and pathway enrichment analysis,STRING database was used for protein interaction network analysis,and the core network was ex? tracted by MCODE algorithm.Results A total of 192 differential genes were screened.GO and signaling pathway enrichment analy?sis found that these genes were related to lipid metabolism,angiogenesis,PPAR signaling pathway,and fatty acid degradation signal?ing pathway.Protein?protein interaction network analysis obtained an interaction network containing 131 genes,and MCODE algo? rithm analysis extracted five core subnetworks,which were respectively related to cholesterol balance,insulin secretion,iron ion bal? ance,angiogenesis and growth hormone receptor signaling pathway.Conclusion The effects of estrogen on cardiovascular system are related to lipid metabolism,insulin secretion,angiogenesis and cell growth by using data mining technology.
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